Általános Igazgatás
Élelmiszer-tudományi Főosztály
Élelmiszer-analitikai Osztály
Biológiai Osztály
Technológiai és Élelmiszerlánc-vizsgálati Osztály
Agrárkörnyezet-biztonsági Főosztály
Környezetanalitikai Osztály
Környezeti és Alkalmazott Mikrobiológiai Osztály
Ökotoxikológiai Osztály
Gazdasági és Szolgáltató Osztály